As Comissões Especializadas são órgãos com carácter permanente e os Grupos de Trabalho e Núcleos órgãos com carácter temporário, que têm como objetivos centrais a análise e o debate de temáticas ligadas às áreas de que se ocupam, promovendo a difusão de conhecimentos e o intercâmbio de experiências entre os associados interessados, a organização das atividades formativas e informativas básicas da APDA e o acompanhamento das atividades das associações e comissões técnicas, nacionais e internacionais, ligadas ao sector.
No seio da APDA funcionam atualmente catorze comissões Especializadas e um Núcleo: